Photo de la triple nef de l'église des Jésuites construite de 1615 à 1617, face au narthex surmonté de l'orgue de tribune élevé par Jean André Silbermann en 1781. Description de l'église des Jésuites de Molsheim.

L'intérieur de l'église des Jésuites comprend une triple nef, le vaisseau central abrite un orgue Silbermann de 1781, une chaire en bois et de 1631 et une statue de procession dorée de la Vierge à l'Enfant du XVIIIe siècle. Le narthex et les collatéraux sont surmontés de balcons, la collatérale Sud est munie d'un autel dédié à Saint Jean Baptiste représentant le baptême de Jésus, la collatérale Nord un autel dédié à la Vierge à l'Enfant. Le choeur de l'église des Jésuites est séparé de la nef centrale par un arc triomphal en grès rose avec quatre statues de lions, le maître-autel néo-gothique en bois du XIXe siècle comprend les statues de Saint Sébastien, Saint Roch, Saint Materne et Saint Arbogast, elles sont surmontées de Saint Georges encadré de 4 anges. Autour du choeur sont disposées 4 statues du XVIIIe siècle: Saint Joseph et l'Enfant Jésus, une Vierge à l'Enfant, Saint Erasme et Sainte Apollinie, l'ensemble est illuminé par 9 grandes verrières à trois et quatre lancettes, dont la centrale illustre Sainte Odile patronne de l'Alsace, Saint Léger évêque d'Autun, Saint Léon IX pape alsacien de 1049 à 1054 et Sainte Richarde impératrice et fondatrice de l'abbaye d'Andlau. Les deux magnifiques chapelles de style baroque de l'église des Jésuite de Molsheim sont dédiées, dans le transept Sud à la Vierge Marie et dans le transept Nord au fondateur de l'ordre des Jésuites Saint Ignace de Loyola.